繁华时尚的忍者岛，乐高小人们过着快乐无忧的日子，除了……隔三差五会遭到邪恶魔头加满都（贾斯汀·塞洛克斯 Justin Theroux 配音）的入侵骚扰外。当然，幸亏有英勇无畏的幻影忍者，他们一次次挺身而出，与魔王大战，才使得忍者岛免于被邪恶统治的危险。绿色忍者劳埃德（戴夫·弗兰科 Dave Franco 饰）是加满都的亲生儿子，不知道他忍者身份的市民们因此经常嘲笑辱骂劳埃德。郁闷的青年只得将一腔怒火撒在以破坏为乐趣的加满都身上。在又一次遭到挫败后，加满都带着威力更强大的军团卷土重来。关键时刻，劳埃德启动了吴大师（成龙 配音）禁止使用的终极武器，最终给忍者岛带来毁灭性的灾难。　　为了拯救忍者岛，幻影忍者们跋山涉水，甚至与加满都展开了合作……

在遥远的尼雅戈王国，六名年轻的忍者——劳埃德、凯、科尔、赞恩、杰和妮娅——团结一致，抵御邪恶的领主加玛当。

影片开场于加玛当进攻尼雅戈城，目标是夺取终极武器：绿能忍者劳埃德手中的绿色机甲。忍者们奋力反击，但寡不敌众，城市陷落。

加玛当控制了尼雅戈，奴役了其居民。忍者们被迫逃离，寻求帮助。他们找到了神经病的老大师吴，他训练他们掌握古老的旋风术，一种强大的能量。

同时，劳埃德的父亲，邪恶的加玛当，被揭露为他的生父。加玛当试图拉拢劳埃德加入黑暗势力，但劳埃德拒绝了。

忍者们规划了一次大胆的行动，潜入加玛当的巢穴拯救被奴役的居民。在混战中，凯牺牲自我，为同伴争取了时间。

劳埃德利用旋风术的力量，击败了加玛当，释放了他的邪恶。然而，劳埃德自己的力量失控，威胁到了城市。

在吴大师的指导下，劳埃德学会了控制自己的力量，并将它化为维护正义的武器。忍者们团结起来，重建尼雅戈城，建立了一个和平与和谐的社会。

影片的结尾，劳埃德以绿能忍者的身份，成为尼雅戈王国的希望和象征。忍者们继续保卫王国，打击邪恶，维护正义。

深入剧情：

劳埃德的成长：劳埃德从一个任性的孩子成长为一名坚强而负责的领导者，学会了运用自己的力量为善。

忍者们的团结：忍者们来自不同的背景，有着不同的个性，但他们团结一致，互相扶持，共同面对挑战。

吴大师的智慧：吴大师是一位睿智的老者，指导忍者们掌握旋风术，教授他们人生和正义的真谛。

凯的牺牲：凯的自我牺牲是一个感人的时刻，展示了忍者们为了保护他人的无私精神。

加玛当的邪恶：加玛当是一个强大的对手，他的邪恶野心对尼雅戈构成了严重的威胁。